El objetivo del programa de Maestría en Ciencias Aplicadas es el formar recursos humanos de alto nivel, en temas científicos de vanguardia con potencial tecnológico y/o aplicado, los cuales puedan impactar favorablemente en el desarrollo tecnológico regional y nacional. Los estudiantes graduados tendrán habilidades de innovación tecnológica y del quehacer científico con las cuales podrán desempeñarse en puestos técnicos en la Industria, en docencia y/o en tareas de investigación en áreas afines. Se busca además establecer bases sólidas en la formación académica de los egresados, con las cuales puedan continuar un doctorado en Instituciones Nacionales o Internacionales